Jens Pesel wurde 1945 geboren. Von 1969 bis 1971 war er Assistent bei den Bayreuther Festspielen und am Thalia Theater in Hamburg. Von 1970 bis 1974 Regieassistent an den Münchner Kammerspielen, während dieser Zeit auch Schauspiellehrer an der Otto-Falckenberg-Schule in München.
Seit 1974 erste Inszenierungen an den Münchner Kammerspielen und Gastinszenierungen an anderen Häusern. In diesem Jahr holte ihn Benno Besson als Mitarbeiter und Regisseur an die Volksbühne in Berlin-Ost. In dieser Zeit entstanden auch außerhalb Berlins Inszenierungen. Ab 1978 – nach Abschluss der Intendanz Benno Bessons – wurde Jens Pesel weiterhin als Gastregisseur für die Volksbühne verpflichtet. 1981 folgte ein Engagement am Staatstheater Darmstadt, wo er 1983 die Leitung der Sparte Schauspiel übernahm. Nach acht Jahren Theaterarbeit in Darmstadt mit rund 30 Inszenierungen war Jens Pesel als freier Regisseur in Bern, Zürich, Salzburg und Nürnberg tätig. Ab der Spielzeit 1992/1993 war er Schauspieldirektor am Theater Dortmund. Von 1996 bis 2010 war Jens Pesel Generalintendant der Vereinigten Städtischen Bühnen Krefeld und Mönchengladbach.In der Spielzeit 2010/2011 kommt er als Gastregisseur von Ibsens Drama \"Hedda Gabler\" zurück an den Niederrhein.